Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RelbQ04863 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RelbQ04863 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RelbQ04863 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RelbQ04863 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RelbQ04863 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RelbQ04863 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RelbQ04863 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms