Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Top1Q04750 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Top1Q04750 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top1Q04750 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top1Q04750 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top1Q04750 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top1Q04750 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top1Q04750 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top1Q04750 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top1Q04750 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Top1Q04750 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top1Q04750 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Top1Q04750 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Top1Q04750 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Top1Q04750 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Top1Q04750 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms