Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smpd1Q04519 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpd1Q04519 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms