Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms