Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thbs2Q03350 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thbs2Q03350 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms