Protein–RNA interactions for Protein: Q03157

Aplp1, Amyloid-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp1Q03157 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Aplp1Q03157 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aplp1Q03157 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aplp1Q03157 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aplp1Q03157 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aplp1Q03157 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aplp1Q03157 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aplp1Q03157 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aplp1Q03157 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aplp1Q03157 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Aplp1Q03157 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aplp1Q03157 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aplp1Q03157 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aplp1Q03157 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aplp1Q03157 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aplp1Q03157 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aplp1Q03157 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Aplp1Q03157 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Aplp1Q03157 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Aplp1Q03157 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Aplp1Q03157 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Aplp1Q03157 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Aplp1Q03157 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Aplp1Q03157 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aplp1Q03157 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aplp1Q03157 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aplp1Q03157 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aplp1Q03157 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aplp1Q03157 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Aplp1Q03157 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aplp1Q03157 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aplp1Q03157 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aplp1Q03157 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aplp1Q03157 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aplp1Q03157 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aplp1Q03157 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Aplp1Q03157 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms