Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gjb4Q02738 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb4Q02738 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms