Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms