Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms