Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AlkP97793 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
AlkP97793 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.56■■■□□ 2
AlkP97793 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AlkP97793 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AlkP97793 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.56■■■□□ 2
AlkP97793 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AlkP97793 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.56■■■□□ 2
AlkP97793 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AlkP97793 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AlkP97793 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
AlkP97793 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AlkP97793 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AlkP97793 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AlkP97793 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.55■■■□□ 2
AlkP97793 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AlkP97793 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AlkP97793 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AlkP97793 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AlkP97793 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AlkP97793 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AlkP97793 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AlkP97793 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AlkP97793 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
AlkP97793 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
AlkP97793 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AlkP97793 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AlkP97793 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AlkP97793 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AlkP97793 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AlkP97793 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
AlkP97793 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
AlkP97793 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
AlkP97793 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AlkP97793 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AlkP97793 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AlkP97793 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.52■■■□□ 2
AlkP97793 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AlkP97793 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AlkP97793 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AlkP97793 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AlkP97793 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AlkP97793 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AlkP97793 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AlkP97793 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AlkP97793 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AlkP97793 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AlkP97793 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AlkP97793 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AlkP97793 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AlkP97793 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AlkP97793 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AlkP97793 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AlkP97793 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AlkP97793 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AlkP97793 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AlkP97793 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AlkP97793 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AlkP97793 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AlkP97793 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AlkP97793 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AlkP97793 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AlkP97793 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AlkP97793 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AlkP97793 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AlkP97793 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AlkP97793 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AlkP97793 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AlkP97793 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AlkP97793 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AlkP97793 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AlkP97793 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AlkP97793 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AlkP97793 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AlkP97793 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AlkP97793 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AlkP97793 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AlkP97793 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AlkP97793 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AlkP97793 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AlkP97793 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AlkP97793 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AlkP97793 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AlkP97793 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AlkP97793 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AlkP97793 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AlkP97793 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AlkP97793 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AlkP97793 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AlkP97793 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AlkP97793 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AlkP97793 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
AlkP97793 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
AlkP97793 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
AlkP97793 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AlkP97793 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AlkP97793 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AlkP97793 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
AlkP97793 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AlkP97793 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms