Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ElocP83940 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ElocP83940 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ElocP83940 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ElocP83940 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ElocP83940 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ElocP83940 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ElocP83940 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ElocP83940 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ElocP83940 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ElocP83940 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ElocP83940 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ElocP83940 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ElocP83940 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ElocP83940 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ElocP83940 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ElocP83940 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ElocP83940 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ElocP83940 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ElocP83940 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ElocP83940 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ElocP83940 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ElocP83940 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ElocP83940 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ElocP83940 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ElocP83940 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ElocP83940 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ElocP83940 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ElocP83940 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ElocP83940 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ElocP83940 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ElocP83940 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ElocP83940 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ElocP83940 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ElocP83940 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ElocP83940 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ElocP83940 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ElocP83940 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ElocP83940 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ElocP83940 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElocP83940 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElocP83940 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElocP83940 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElocP83940 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElocP83940 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElocP83940 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElocP83940 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElocP83940 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ElocP83940 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElocP83940 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElocP83940 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElocP83940 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElocP83940 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElocP83940 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElocP83940 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElocP83940 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElocP83940 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElocP83940 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ElocP83940 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ElocP83940 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ElocP83940 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ElocP83940 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ElocP83940 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ElocP83940 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ElocP83940 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ElocP83940 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ElocP83940 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ElocP83940 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ElocP83940 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ElocP83940 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ElocP83940 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ElocP83940 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ElocP83940 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ElocP83940 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ElocP83940 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ElocP83940 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ElocP83940 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ElocP83940 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ElocP83940 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ElocP83940 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ElocP83940 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ElocP83940 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ElocP83940 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ElocP83940 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ElocP83940 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ElocP83940 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ElocP83940 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ElocP83940 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ElocP83940 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ElocP83940 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ElocP83940 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ElocP83940 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ElocP83940 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ElocP83940 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ElocP83940 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ElocP83940 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ElocP83940 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ElocP83940 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ElocP83940 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ElocP83940 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms