Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubg1P83887 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms