Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSBP2P81877 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms