Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx1P81068 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx1P81068 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx1P81068 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx1P81068 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx1P81068 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx1P81068 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Irx1P81068 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx1P81068 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx1P81068 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx1P81068 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx1P81068 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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