Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gjb6P70689 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms