Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stra8P70278 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stra8P70278 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stra8P70278 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stra8P70278 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stra8P70278 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stra8P70278 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stra8P70278 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stra8P70278 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stra8P70278 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Stra8P70278 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Stra8P70278 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stra8P70278 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Stra8P70278 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms