Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chl1P70232 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chl1P70232 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chl1P70232 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chl1P70232 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chl1P70232 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chl1P70232 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chl1P70232 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chl1P70232 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chl1P70232 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms