Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acta1P68134 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acta1P68134 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acta1P68134 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acta1P68134 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Acta1P68134 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acta1P68134 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta1P68134 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta1P68134 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms