Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf6P62331 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf6P62331 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf6P62331 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf6P62331 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf6P62331 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf6P62331 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf6P62331 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms