Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SnrpfP62307 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpfP62307 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms