Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps13P62301 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps13P62301 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps13P62301 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps13P62301 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms