Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmo4P61969 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms