Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms