Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2d3P61079 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2d3P61079 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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