Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap25P60879 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap25P60879 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap25P60879 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap25P60879 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap25P60879 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snap25P60879 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap25P60879 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap25P60879 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap25P60879 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap25P60879 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap25P60879 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms