Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nphp4P59240 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms