Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pcif1P59114 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcif1P59114 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms