Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P58686 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P58686 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P58686 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P58686 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P58686 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P58686 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P58686 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P58686 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P58686 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P58686 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P58686 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P58686 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P58686 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P58686 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P58686 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P58686 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P58686 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P58686 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P58686 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P58686 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P58686 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P58686 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P58686 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P58686 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P58686 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P58686 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P58686 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P58686 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P58686 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P58686 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P58686 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P58686 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P58686 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P58686 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P58686 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P58686 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P58686 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P58686 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P58686 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P58686 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P58686 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P58686 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P58686 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P58686 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P58686 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P58686 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P58686 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P58686 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P58686 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P58686 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P58686 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P58686 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P58686 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P58686 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P58686 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P58686 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P58686 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P58686 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P58686 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P58686 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P58686 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P58686 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P58686 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P58686 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P58686 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P58686 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P58686 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P58686 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P58686 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P58686 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P58686 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P58686 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P58686 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P58686 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P58686 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P58686 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P58686 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P58686 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P58686 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P58686 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P58686 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P58686 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P58686 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P58686 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P58686 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P58686 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P58686 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P58686 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P58686 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P58686 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms