Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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