Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smpdl3bP58242 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms