Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms