Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Exosc10P56960 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms