Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1P55194 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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