Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acod1P54987 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acod1P54987 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acod1P54987 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acod1P54987 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acod1P54987 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acod1P54987 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acod1P54987 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acod1P54987 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acod1P54987 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Acod1P54987 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acod1P54987 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acod1P54987 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acod1P54987 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acod1P54987 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acod1P54987 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acod1P54987 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acod1P54987 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms