Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms