Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Map3k1P53349 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Map3k1P53349 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms