Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccr5P51682 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccr5P51682 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms