Protein–RNA interactions for Protein: P51678

Ccr3, Probable C-C chemokine receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr3P51678 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr3P51678 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr3P51678 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms