Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ercc3P49135 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms