Protein–RNA interactions for Protein: P47880

Igfbp6, Insulin-like growth factor-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp6P47880 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Igfbp6P47880 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Igfbp6P47880 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Igfbp6P47880 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Igfbp6P47880 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Igfbp6P47880 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Igfbp6P47880 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Igfbp6P47880 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Igfbp6P47880 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Igfbp6P47880 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Igfbp6P47880 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Igfbp6P47880 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igfbp6P47880 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Igfbp6P47880 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms