Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zic1P46684 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic1P46684 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zic1P46684 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms