Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms