Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf1P46099 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf1P46099 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf1P46099 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf1P46099 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf1P46099 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf1P46099 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf1P46099 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf1P46099 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf1P46099 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf1P46099 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf1P46099 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf1P46099 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Klf1P46099 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms