Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ItgavP43406 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgavP43406 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgavP43406 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ItgavP43406 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgavP43406 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgavP43406 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgavP43406 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgavP43406 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgavP43406 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ItgavP43406 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgavP43406 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ItgavP43406 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ItgavP43406 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ItgavP43406 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ItgavP43406 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms