Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pik3caP42337 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3caP42337 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pik3caP42337 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3caP42337 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3caP42337 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3caP42337 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3caP42337 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3caP42337 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3caP42337 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3caP42337 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3caP42337 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms