Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc19a1P41438 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms