Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp9P41245 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms