Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox7P40646 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox7P40646 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox7P40646 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox7P40646 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox7P40646 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox7P40646 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox7P40646 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms