Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk2P38575 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk2P38575 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk2P38575 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk2P38575 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk2P38575 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk2P38575 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk2P38575 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk2P38575 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk2P38575 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms