Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sar1aP36536 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sar1aP36536 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms